MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 57966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009922	GAG	2	6	186264	186269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319214
3002	NC_009922	A	6	6	186333	186338	100 %	0 %	0 %	0 %	158319214
3003	NC_009922	TA	4	8	186365	186372	50 %	50 %	0 %	0 %	158319214
3004	NC_009922	AATTT	2	10	186440	186449	40 %	60 %	0 %	0 %	158319215
3005	NC_009922	TGA	2	6	186512	186517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319215
3006	NC_009922	AACTAG	2	12	186526	186537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158319215
3007	NC_009922	ATT	2	6	186575	186580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319215
3008	NC_009922	T	6	6	186619	186624	0 %	100 %	0 %	0 %	158319215
3009	NC_009922	TAC	2	6	186676	186681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319215
3010	NC_009922	AAT	2	6	186682	186687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319215
3011	NC_009922	CTT	2	6	186709	186714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319215
3012	NC_009922	TTC	2	6	186724	186729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319215
3013	NC_009922	AGC	2	6	186824	186829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319215
3014	NC_009922	TCA	2	6	186834	186839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319215
3015	NC_009922	ATG	2	6	186878	186883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319215
3016	NC_009922	ATT	2	6	186920	186925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319215
3017	NC_009922	CCCA	2	8	186943	186950	25 %	0 %	0 %	75 %	158319215
3018	NC_009922	TGAT	2	8	186974	186981	25 %	50 %	25 %	0 %	158319215
3019	NC_009922	AT	3	6	186980	186985	50 %	50 %	0 %	0 %	158319215
3020	NC_009922	ATTTC	2	10	187136	187145	20 %	60 %	0 %	20 %	158319216
3021	NC_009922	TCT	2	6	187162	187167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
3022	NC_009922	TGAA	2	8	187255	187262	50 %	25 %	25 %	0 %	158319216
3023	NC_009922	CTT	2	6	187333	187338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
3024	NC_009922	TCA	2	6	187430	187435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
3025	NC_009922	TCA	2	6	187511	187516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
3026	NC_009922	TAT	2	6	187575	187580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319216
3027	NC_009922	GGC	2	6	187645	187650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319216
3028	NC_009922	TGAA	2	8	187676	187683	50 %	25 %	25 %	0 %	158319216
3029	NC_009922	GT	3	6	187787	187792	0 %	50 %	50 %	0 %	158319216
3030	NC_009922	AG	3	6	188062	188067	50 %	0 %	50 %	0 %	158319216
3031	NC_009922	AT	3	6	188079	188084	50 %	50 %	0 %	0 %	158319216
3032	NC_009922	T	7	7	188084	188090	0 %	100 %	0 %	0 %	158319216
3033	NC_009922	ATC	2	6	188095	188100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
3034	NC_009922	GAT	2	6	188110	188115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319216
3035	NC_009922	GAA	2	6	188121	188126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319216
3036	NC_009922	CTT	2	6	188136	188141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
3037	NC_009922	CAT	2	6	188142	188147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
3038	NC_009922	AT	3	6	188198	188203	50 %	50 %	0 %	0 %	158319216
3039	NC_009922	GTG	2	6	188205	188210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319216
3040	NC_009922	ATC	2	6	188243	188248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
3041	NC_009922	CTT	2	6	188256	188261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
3042	NC_009922	GAA	2	6	188274	188279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319216
3043	NC_009922	CT	3	6	188319	188324	0 %	50 %	0 %	50 %	158319216
3044	NC_009922	ATA	2	6	188365	188370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319216
3045	NC_009922	AGA	3	9	188425	188433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319216
3046	NC_009922	TTA	2	6	188444	188449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319216
3047	NC_009922	AGT	2	6	188550	188555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319216
3048	NC_009922	CAT	2	6	188559	188564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
3049	NC_009922	TAG	2	6	188587	188592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319216
3050	NC_009922	AT	3	6	188796	188801	50 %	50 %	0 %	0 %	158319217
3051	NC_009922	ACCA	2	8	188802	188809	50 %	0 %	0 %	50 %	158319217
3052	NC_009922	AAT	2	6	188814	188819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319217
3053	NC_009922	AGGG	2	8	188844	188851	25 %	0 %	75 %	0 %	158319217
3054	NC_009922	T	6	6	189039	189044	0 %	100 %	0 %	0 %	158319217
3055	NC_009922	TTC	2	6	189072	189077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319218
3056	NC_009922	TTC	2	6	189162	189167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319218
3057	NC_009922	CTT	2	6	189242	189247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319218
3058	NC_009922	TAC	2	6	189281	189286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319218
3059	NC_009922	TTC	2	6	189328	189333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319218
3060	NC_009922	T	6	6	189334	189339	0 %	100 %	0 %	0 %	158319218
3061	NC_009922	T	6	6	189395	189400	0 %	100 %	0 %	0 %	158319218
3062	NC_009922	ATG	2	6	189478	189483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319218
3063	NC_009922	GGA	2	6	189497	189502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319218
3064	NC_009922	ATA	2	6	189513	189518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319218
3065	NC_009922	CTTCAA	2	12	189549	189560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319218
3066	NC_009922	AAT	2	6	189818	189823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319219
3067	NC_009922	ATA	2	6	189828	189833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319219
3068	NC_009922	GAA	2	6	189838	189843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319219
3069	NC_009922	ACT	2	6	189845	189850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319219
3070	NC_009922	CCA	2	6	189852	189857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319219
3071	NC_009922	CTG	2	6	189881	189886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319219
3072	NC_009922	TCAC	2	8	189924	189931	25 %	25 %	0 %	50 %	158319219
3073	NC_009922	ATATGA	2	12	189939	189950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319219
3074	NC_009922	CTT	2	6	189970	189975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319219
3075	NC_009922	ATT	2	6	190001	190006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319219
3076	NC_009922	CAT	3	9	190016	190024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319219
3077	NC_009922	GGAT	2	8	190044	190051	25 %	25 %	50 %	0 %	158319219
3078	NC_009922	AT	4	8	190058	190065	50 %	50 %	0 %	0 %	158319219
3079	NC_009922	ATT	2	6	190912	190917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319220
3080	NC_009922	AGT	2	6	190975	190980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319220
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3082	NC_009922	TTA	2	6	191021	191026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319220
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3085	NC_009922	GGA	2	6	191194	191199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319220
3086	NC_009922	GAA	2	6	191357	191362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319220
3087	NC_009922	TGA	2	6	191373	191378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319220
3088	NC_009922	GCT	2	6	191383	191388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319220
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3090	NC_009922	GGT	2	6	191406	191411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319220
3091	NC_009922	GAA	2	6	191419	191424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319220
3092	NC_009922	ATG	2	6	191446	191451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319220
3093	NC_009922	TAA	2	6	191505	191510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319220
3094	NC_009922	GATTTA	2	12	191518	191529	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319220
3095	NC_009922	AGA	2	6	191580	191585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319220
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3097	NC_009922	TGGT	2	8	191752	191759	0 %	50 %	50 %	0 %	158319221
3098	NC_009922	TGA	2	6	191782	191787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319221
3099	NC_009922	CTGTT	2	10	191831	191840	0 %	60 %	20 %	20 %	158319221
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3102	NC_009922	A	6	6	191918	191923	100 %	0 %	0 %	0 %	158319221
3103	NC_009922	T	7	7	191935	191941	0 %	100 %	0 %	0 %	158319221
3104	NC_009922	ATCC	2	8	192041	192048	25 %	25 %	0 %	50 %	158319221
3105	NC_009922	ATC	2	6	192063	192068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319221
3106	NC_009922	TGG	2	6	192074	192079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319221
3107	NC_009922	AGTG	2	8	192080	192087	25 %	25 %	50 %	0 %	158319221
3108	NC_009922	TTG	2	6	192091	192096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319221
3109	NC_009922	AGA	2	6	192153	192158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319221
3110	NC_009922	CAC	2	6	192217	192222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319221
3111	NC_009922	TAT	2	6	192302	192307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319221
3112	NC_009922	TTG	2	6	192312	192317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319221
3113	NC_009922	TA	3	6	192331	192336	50 %	50 %	0 %	0 %	158319221
3114	NC_009922	TAAA	2	8	192343	192350	75 %	25 %	0 %	0 %	158319221
3115	NC_009922	ATTA	2	8	192443	192450	50 %	50 %	0 %	0 %	158319221
3116	NC_009922	ATTA	2	8	192461	192468	50 %	50 %	0 %	0 %	158319221
3117	NC_009922	TATT	2	8	192535	192542	25 %	75 %	0 %	0 %	158319221
3118	NC_009922	TAAA	2	8	192547	192554	75 %	25 %	0 %	0 %	158319221
3119	NC_009922	TGT	2	6	192635	192640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319221
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3121	NC_009922	TTG	2	6	192721	192726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319221
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3246	NC_009922	AGC	2	6	198466	198471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319226
3247	NC_009922	AGGAA	2	10	198514	198523	60 %	0 %	40 %	0 %	158319226
3248	NC_009922	AGC	2	6	198560	198565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319226
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3262	NC_009922	T	6	6	198973	198978	0 %	100 %	0 %	0 %	158319226
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3353	NC_009922	TGCA	2	8	204928	204935	25 %	25 %	25 %	25 %	158319231
3354	NC_009922	TCA	2	6	204938	204943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319231
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3357	NC_009922	ATC	2	6	205051	205056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319231
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3359	NC_009922	CAG	2	6	205107	205112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319231
3360	NC_009922	AAAG	2	8	205156	205163	75 %	0 %	25 %	0 %	158319231
3361	NC_009922	AGC	2	6	205168	205173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319231
3362	NC_009922	GATG	2	8	205194	205201	25 %	25 %	50 %	0 %	158319231
3363	NC_009922	CGA	2	6	205219	205224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319231
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3365	NC_009922	TTC	2	6	205381	205386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319231
3366	NC_009922	ATCC	2	8	205462	205469	25 %	25 %	0 %	50 %	158319231
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3492	NC_009922	CTT	2	6	212328	212333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319236
3493	NC_009922	CTT	2	6	212454	212459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319237
3494	NC_009922	T	6	6	212523	212528	0 %	100 %	0 %	0 %	158319237
3495	NC_009922	TGT	2	6	212530	212535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319237
3496	NC_009922	GATG	2	8	212543	212550	25 %	25 %	50 %	0 %	158319237
3497	NC_009922	GAC	2	6	212576	212581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319237
3498	NC_009922	GTT	2	6	212654	212659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319237
3499	NC_009922	CT	3	6	212684	212689	0 %	50 %	0 %	50 %	158319237
3500	NC_009922	GGA	2	6	212729	212734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319237

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